李仪址在大力介绍西方水利科学知识的同时，十分注意收集整理水利历史文献和介绍中国的传统水利知识。他在任河海工程专门学校教务长制定教学计划时，专门设置“中国水利史课程”，介绍历代水利问题和治理经验。在他的倡导和支持下，由汪胡桢等具体负责，中国水利工程学会组织出版了一套《水利珍本丛书》，准备把古代重要的水利专注都点校再版，向国人介绍，以便继承和发掘传统水利的精华，为振兴中国水利服务。已经出版的有明代刘天和的《问水集》、潘季驯的《河防一览》、靳辅的《治河方略》、《清代河臣传》等，后因抗日战争爆发而被迫中断。

第三，水利规划思想。对于河流的治理和水资源的开发利用，中国自周秦以来就有过许多好的意见和主张，但始终未能全面付诸实践，治理开发中总是单打一居多。李仪祉继承了历史上的正确主张，又根据西方近代治水思想的新主张，形成了他的“全面开发、综合利用”的水利规划思想，把中国数千年的传统治水思想推向一个新阶段。

李仪祉主张的综合治理，首先是实现防洪的目标，同时考虑航运、灌溉、发电等综合利用目的。他认为，一个流域的水系是一个有机体，必须综合治理。只有调查收集各种技术资料，进行分析整理，才能提出流域的治本计划或意见。1934年，他在《治理黄河工作纲要》中对黄河进行了全面规划。强调黄河治理要兼顾上、中、下游，在抓好下游防洪的同时，特别要重视治理河流上、中游。这对数千年来治河防洪工程始终在下游下功夫的方针是一个根本的扭转。此外，李仪祉还按照“综合治水”的思想，亲自领导制定了导淮计划，黄河治本计划，陕西水利纲要等流域和区域的水利规划，主持或参加了长江、海河、运河等其他许多流域和地区的水利规划。

第四，水利教育思想。李仪祉自1915年留学归国，正值南通张謇创办河海工程专门学校，聘请他为教务长。这是我国第一所水利学校，一切课程设置、教学安排，都由李仪祉负责。此后的八年中，李仪祉先生主要从事水利教育工作。这是我国现代水利教育的开创阶段。李仪祉在教育实践中，一是注重理论联系实际，经常组织到各江河勘察实习、收集资料。二是大量运用水工模型，形象直观地授课，为培养我国早期水利科技人才作出了重要贡献。离开河海工程专门学校后，他依然十分注意培养水利人才，尤其重视现代水利知识的普及教育，先后创办了陕西水利道路工程学校，陕西水利专修班以及水利民众学校。此外，他还通过举办水利展览、广播讲座等方式向民众宣传普及水利知识和水利兴国的重大意义。在培养水利人才方面，充分体现了他注重实践、注重普及的水利教育思想。

第五，水利行政思想。李仪祉认为，要振兴水利事业，使水利建设卓有成效，必须对河流治理和水资源的开发加强立法管理，必须统一水政。要开展全国性的水利立法，通过依法治水，加强水资源和水利工程的管理和保护，依法禁止各种破坏大局利益的活动，并通过立法来调节裁决水利纠纷。此外，他还认为要建立区域性的和专项工程的水利行政法规。在规划思想上，李仪祉主张综合治水，上、中、下游并重。在管理体制上，李仪祉主张水政统一，河政统一，机构精简有效。